Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP6P35125 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP6P35125 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP6P35125 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP6P35125 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP6P35125 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP6P35125 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP6P35125 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP6P35125 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP6P35125 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP6P35125 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP6P35125 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP6P35125 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP6P35125 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
USP6P35125 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
USP6P35125 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP6P35125 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP6P35125 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP6P35125 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP6P35125 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP6P35125 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP6P35125 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP6P35125 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP6P35125 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP6P35125 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP6P35125 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP6P35125 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP6P35125 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP6P35125 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP6P35125 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USP6P35125 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USP6P35125 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USP6P35125 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USP6P35125 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USP6P35125 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP6P35125 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP6P35125 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP6P35125 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP6P35125 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
USP6P35125 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP6P35125 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP6P35125 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP6P35125 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP6P35125 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP6P35125 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP6P35125 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP6P35125 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP6P35125 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP6P35125 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP6P35125 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP6P35125 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP6P35125 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP6P35125 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP6P35125 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP6P35125 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP6P35125 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP6P35125 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP6P35125 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP6P35125 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP6P35125 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP6P35125 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP6P35125 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP6P35125 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP6P35125 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP6P35125 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP6P35125 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP6P35125 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP6P35125 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP6P35125 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP6P35125 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP6P35125 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP6P35125 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP6P35125 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP6P35125 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP6P35125 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP6P35125 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP6P35125 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP6P35125 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP6P35125 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP6P35125 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP6P35125 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP6P35125 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP6P35125 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP6P35125 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP6P35125 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP6P35125 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6P35125 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6P35125 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6P35125 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6P35125 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6P35125 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6P35125 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6P35125 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6P35125 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6P35125 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6P35125 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6P35125 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6P35125 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6P35125 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6P35125 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms