Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TSPOP30536 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TSPOP30536 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TSPOP30536 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
TSPOP30536 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TSPOP30536 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TSPOP30536 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TSPOP30536 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TSPOP30536 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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