Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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