Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms