Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALB2P22676 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALB2P22676 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALB2P22676 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALB2P22676 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALB2P22676 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALB2P22676 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALB2P22676 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALB2P22676 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALB2P22676 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALB2P22676 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALB2P22676 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALB2P22676 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALB2P22676 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALB2P22676 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALB2P22676 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALB2P22676 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALB2P22676 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALB2P22676 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALB2P22676 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALB2P22676 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CALB2P22676 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALB2P22676 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALB2P22676 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALB2P22676 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALB2P22676 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALB2P22676 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALB2P22676 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALB2P22676 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALB2P22676 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALB2P22676 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALB2P22676 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALB2P22676 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALB2P22676 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALB2P22676 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALB2P22676 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALB2P22676 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALB2P22676 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALB2P22676 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALB2P22676 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALB2P22676 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALB2P22676 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALB2P22676 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CALB2P22676 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALB2P22676 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALB2P22676 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALB2P22676 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALB2P22676 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms