Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPN3P20807 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPN3P20807 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPN3P20807 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPN3P20807 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPN3P20807 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPN3P20807 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPN3P20807 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPN3P20807 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPN3P20807 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPN3P20807 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPN3P20807 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPN3P20807 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPN3P20807 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPN3P20807 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPN3P20807 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPN3P20807 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPN3P20807 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPN3P20807 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPN3P20807 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPN3P20807 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPN3P20807 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPN3P20807 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPN3P20807 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPN3P20807 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPN3P20807 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPN3P20807 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPN3P20807 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPN3P20807 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPN3P20807 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPN3P20807 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPN3P20807 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPN3P20807 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPN3P20807 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPN3P20807 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPN3P20807 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPN3P20807 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms