Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
XBP1P17861 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
XBP1P17861 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
XBP1P17861 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
XBP1P17861 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
XBP1P17861 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
XBP1P17861 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
XBP1P17861 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
XBP1P17861 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
XBP1P17861 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
XBP1P17861 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
XBP1P17861 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
XBP1P17861 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
XBP1P17861 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
XBP1P17861 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
XBP1P17861 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
XBP1P17861 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
XBP1P17861 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
XBP1P17861 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
XBP1P17861 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
XBP1P17861 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
XBP1P17861 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
XBP1P17861 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
XBP1P17861 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
XBP1P17861 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
XBP1P17861 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
XBP1P17861 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
XBP1P17861 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
XBP1P17861 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
XBP1P17861 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
XBP1P17861 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
XBP1P17861 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
XBP1P17861 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
XBP1P17861 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
XBP1P17861 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
XBP1P17861 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
XBP1P17861 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
XBP1P17861 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
XBP1P17861 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
XBP1P17861 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XBP1P17861 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XBP1P17861 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XBP1P17861 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
XBP1P17861 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XBP1P17861 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XBP1P17861 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
XBP1P17861 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XBP1P17861 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XBP1P17861 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
XBP1P17861 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
XBP1P17861 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XBP1P17861 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XBP1P17861 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XBP1P17861 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XBP1P17861 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XBP1P17861 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XBP1P17861 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XBP1P17861 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
XBP1P17861 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
XBP1P17861 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XBP1P17861 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
XBP1P17861 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
XBP1P17861 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
XBP1P17861 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XBP1P17861 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XBP1P17861 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XBP1P17861 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XBP1P17861 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XBP1P17861 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
XBP1P17861 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
XBP1P17861 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XBP1P17861 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XBP1P17861 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XBP1P17861 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
XBP1P17861 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XBP1P17861 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XBP1P17861 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
XBP1P17861 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
XBP1P17861 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
XBP1P17861 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
XBP1P17861 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
XBP1P17861 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
XBP1P17861 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
XBP1P17861 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
XBP1P17861 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
XBP1P17861 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
XBP1P17861 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
XBP1P17861 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
XBP1P17861 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
XBP1P17861 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
XBP1P17861 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
XBP1P17861 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
XBP1P17861 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
XBP1P17861 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
XBP1P17861 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
XBP1P17861 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
XBP1P17861 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
XBP1P17861 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
XBP1P17861 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20■□□□□ 0.79
XBP1P17861 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms