Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NGFRP08138 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NGFRP08138 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NGFRP08138 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NGFRP08138 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NGFRP08138 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NGFRP08138 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NGFRP08138 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NGFRP08138 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NGFRP08138 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NGFRP08138 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NGFRP08138 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NGFRP08138 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NGFRP08138 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NGFRP08138 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NGFRP08138 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NGFRP08138 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NGFRP08138 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NGFRP08138 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NGFRP08138 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NGFRP08138 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NGFRP08138 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NGFRP08138 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NGFRP08138 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NGFRP08138 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NGFRP08138 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NGFRP08138 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NGFRP08138 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NGFRP08138 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NGFRP08138 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NGFRP08138 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NGFRP08138 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NGFRP08138 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NGFRP08138 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NGFRP08138 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NGFRP08138 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NGFRP08138 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NGFRP08138 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms