Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLK3P07288 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLK3P07288 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLK3P07288 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLK3P07288 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLK3P07288 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLK3P07288 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLK3P07288 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLK3P07288 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLK3P07288 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLK3P07288 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLK3P07288 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLK3P07288 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLK3P07288 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
KLK3P07288 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLK3P07288 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLK3P07288 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLK3P07288 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLK3P07288 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLK3P07288 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLK3P07288 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLK3P07288 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLK3P07288 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLK3P07288 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLK3P07288 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KLK3P07288 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLK3P07288 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLK3P07288 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLK3P07288 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLK3P07288 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLK3P07288 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KLK3P07288 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLK3P07288 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KLK3P07288 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLK3P07288 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLK3P07288 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLK3P07288 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLK3P07288 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLK3P07288 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLK3P07288 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLK3P07288 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLK3P07288 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLK3P07288 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLK3P07288 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLK3P07288 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLK3P07288 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLK3P07288 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLK3P07288 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLK3P07288 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLK3P07288 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLK3P07288 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLK3P07288 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLK3P07288 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLK3P07288 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLK3P07288 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLK3P07288 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLK3P07288 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLK3P07288 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLK3P07288 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLK3P07288 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms