Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms