Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG7O95352 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG7O95352 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG7O95352 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG7O95352 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG7O95352 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG7O95352 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG7O95352 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG7O95352 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG7O95352 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG7O95352 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG7O95352 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG7O95352 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG7O95352 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG7O95352 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG7O95352 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG7O95352 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG7O95352 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG7O95352 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG7O95352 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG7O95352 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG7O95352 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG7O95352 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG7O95352 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG7O95352 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG7O95352 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG7O95352 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG7O95352 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG7O95352 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG7O95352 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG7O95352 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG7O95352 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG7O95352 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG7O95352 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG7O95352 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG7O95352 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG7O95352 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG7O95352 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG7O95352 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG7O95352 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG7O95352 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG7O95352 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG7O95352 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG7O95352 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG7O95352 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG7O95352 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG7O95352 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG7O95352 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG7O95352 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG7O95352 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG7O95352 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG7O95352 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG7O95352 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG7O95352 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG7O95352 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG7O95352 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG7O95352 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG7O95352 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG7O95352 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG7O95352 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG7O95352 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG7O95352 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG7O95352 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG7O95352 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG7O95352 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG7O95352 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG7O95352 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG7O95352 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG7O95352 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG7O95352 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG7O95352 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG7O95352 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG7O95352 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG7O95352 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG7O95352 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG7O95352 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG7O95352 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG7O95352 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG7O95352 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG7O95352 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG7O95352 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG7O95352 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG7O95352 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG7O95352 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG7O95352 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG7O95352 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG7O95352 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG7O95352 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG7O95352 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG7O95352 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG7O95352 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG7O95352 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG7O95352 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG7O95352 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG7O95352 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG7O95352 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG7O95352 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG7O95352 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG7O95352 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG7O95352 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms