Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms