Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLGNO14967 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLGNO14967 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLGNO14967 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLGNO14967 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLGNO14967 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLGNO14967 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLGNO14967 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLGNO14967 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLGNO14967 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLGNO14967 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLGNO14967 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLGNO14967 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLGNO14967 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLGNO14967 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLGNO14967 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLGNO14967 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLGNO14967 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLGNO14967 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLGNO14967 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLGNO14967 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLGNO14967 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLGNO14967 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLGNO14967 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLGNO14967 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLGNO14967 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLGNO14967 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLGNO14967 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLGNO14967 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLGNO14967 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLGNO14967 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLGNO14967 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLGNO14967 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLGNO14967 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLGNO14967 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLGNO14967 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLGNO14967 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLGNO14967 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLGNO14967 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLGNO14967 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLGNO14967 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLGNO14967 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CLGNO14967 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLGNO14967 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLGNO14967 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLGNO14967 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLGNO14967 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLGNO14967 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLGNO14967 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLGNO14967 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLGNO14967 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLGNO14967 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLGNO14967 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLGNO14967 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLGNO14967 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLGNO14967 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLGNO14967 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLGNO14967 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLGNO14967 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLGNO14967 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLGNO14967 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLGNO14967 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLGNO14967 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLGNO14967 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLGNO14967 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLGNO14967 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms