Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms