Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms