Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
E9PCH4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
E9PCH4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
E9PCH4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
E9PCH4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E9PCH4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
E9PCH4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E9PCH4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E9PCH4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
E9PCH4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
E9PCH4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
E9PCH4 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
E9PCH4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
E9PCH4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E9PCH4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
E9PCH4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E9PCH4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E9PCH4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E9PCH4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
E9PCH4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
E9PCH4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E9PCH4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E9PCH4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
E9PCH4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
E9PCH4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
E9PCH4 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
E9PCH4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
E9PCH4 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
E9PCH4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
E9PCH4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
E9PCH4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
E9PCH4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
E9PCH4 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
E9PCH4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
E9PCH4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
E9PCH4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
E9PCH4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
E9PCH4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
E9PCH4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
E9PCH4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
E9PCH4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
E9PCH4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
E9PCH4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
E9PCH4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
E9PCH4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
E9PCH4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
E9PCH4 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
E9PCH4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
E9PCH4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
E9PCH4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
E9PCH4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
E9PCH4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
E9PCH4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
E9PCH4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
E9PCH4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
E9PCH4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E9PCH4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E9PCH4 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
E9PCH4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
E9PCH4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
E9PCH4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E9PCH4 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E9PCH4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E9PCH4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E9PCH4 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E9PCH4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E9PCH4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
E9PCH4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E9PCH4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E9PCH4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
E9PCH4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E9PCH4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
E9PCH4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E9PCH4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
E9PCH4 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
E9PCH4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
E9PCH4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
E9PCH4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E9PCH4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E9PCH4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E9PCH4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E9PCH4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
E9PCH4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
E9PCH4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E9PCH4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E9PCH4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
E9PCH4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms