Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms