Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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LINC00587B1AMM8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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LINC00587B1AMM8 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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LINC00587B1AMM8 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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LINC00587B1AMM8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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LINC00587B1AMM8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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LINC00587B1AMM8 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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