Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF839A8K0R7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF839A8K0R7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF839A8K0R7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF839A8K0R7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF839A8K0R7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF839A8K0R7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF839A8K0R7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF839A8K0R7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF839A8K0R7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF839A8K0R7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF839A8K0R7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF839A8K0R7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF839A8K0R7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms