Protein–RNA interactions for Protein: A2RRP1

NBAS, Neuroblastoma-amplified sequence, humanhuman

Predictions only

Length 2,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBASA2RRP1 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBASA2RRP1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms