Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms