Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RCE1Q9Y256 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms