Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms