Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms