Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms