Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms