Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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