Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms