Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms