Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms