Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms