Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms