Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BCL11BQ9C0K0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms