Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5DQ9BY66 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5DQ9BY66 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5DQ9BY66 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5DQ9BY66 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5DQ9BY66 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5DQ9BY66 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5DQ9BY66 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5DQ9BY66 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5DQ9BY66 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5DQ9BY66 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5DQ9BY66 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5DQ9BY66 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5DQ9BY66 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms