Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNG6Q9BXT2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNG6Q9BXT2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNG6Q9BXT2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNG6Q9BXT2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNG6Q9BXT2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNG6Q9BXT2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNG6Q9BXT2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNG6Q9BXT2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNG6Q9BXT2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNG6Q9BXT2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms