Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms