Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms