Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms