Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms