Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms