Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms