Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms