Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP3Q96P20 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms