Protein–RNA interactions for Protein: Q96M95

CCDC42, Coiled-coil domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42Q96M95 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC42Q96M95 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms