Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms