Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTV1Q96GA3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms