Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms