Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms