Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms