Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms